課題組長簡介

熊旭深 博士，浙江大學醫(yī)學中心、良渚實驗室“百人計劃”研究員，博士生導師。

熊旭深2014年本科畢業(yè)于華中科技大學生物信息學專業(yè)；2019年博士畢業(yè)于北京大學生命科學學院伊成器教授課題組；2019年起以聯(lián)合博士后身份在麻省理工計算機與人工智能系 Manolis Kellis 教授 (Head, MIT Computational Biology group) 及哈佛醫(yī)學院 Richard Gregory 教授課題組進行計算生物學及疾病表觀遺傳學方向的研究。2022年底，熊旭深博士加入浙江大學醫(yī)學中心/良渚實驗室，成立獨立課題組。

熊旭深博士長期從事以計算生物學和實驗生物學手段相結(jié)合（“干濕結(jié)合”）的方式進行遺傳疾病的多組學調(diào)控機制研究，以第一作者或者共同第一作者發(fā)表Nature Genetics, Molecular Cell, Nature Chemical Biology等多篇高水平文章。Google Scholar 引用超過1500次，H-index=11，獲2019年“吳瑞獎學金”。

熊旭深博士參與發(fā)現(xiàn)了mRNA上m1A新型甲基化修飾，為表觀轉(zhuǎn)錄組在癌癥的研究開辟了新的方向 (Nat Cell Biol. 2016, Mol Cell. 2017, Nat Comm. 2021)，其關(guān)于m6A (Nat Genet., 2021) 及 H3K27ac (Nat Genet., In Revision) 的遺傳學調(diào)控的研究為解析遺傳疾病的遺傳學位點提供了新的思路和不同層次 ，其關(guān)于阿爾茲海默癥的遺傳致病位點定位及調(diào)控解析為尋找可轉(zhuǎn)化的靶位點提供了重要的分子基礎(chǔ) (Cell, In Revision)。

課題組研究方向

本課題組致力于利用計算生物學、人工智能、實驗生物學等多學科交叉的手段進行人類遺傳疾病的跨層次多組學（epigenomics, RNA modification, transcriptomics, etc）機制研究。具體包括以下3個方向：

1. 基于生物信息學和遺傳統(tǒng)計學的多基因遺傳疾�。ㄐ难�管、腦部遺傳疾病等）的多組學（表觀基因組、RNA修飾組、轉(zhuǎn)錄組、翻譯組等）整合分析及因果推斷；

2. 基于機器學習（主要是深度學習）的表觀基因組和表觀轉(zhuǎn)錄組的預(yù)測及關(guān)鍵調(diào)控序列及遺傳位點的鑒定；

3. 基于Organoid，iPSC，動物模型等體外體系及Perturb-seq, CRISPR screening等高通量實驗手段的調(diào)控通量機制研究及驗證。

一、崗位要求

（一）博士后

1、計算生物學、遺傳統(tǒng)計學、人工智能方向（數(shù)名）

a)近期（或即將）取得生物信息、計算機、數(shù)學、統(tǒng)計、物理、數(shù)據(jù)科學等相關(guān)領(lǐng)域的博士學位（無優(yōu)先順序）；

b) 具備扎實的編程能力，具有概率統(tǒng)計、基因組學、深度學習方面知識；

c) 以第一作者（含共同）發(fā)表過SCI論文，有一定的獨立工作能力；

d) 對生物信息學或人工智能在基因組學中的應(yīng)用有研究興趣，有責任心與團隊合作精神；

e) 擁有較為良好的英語溝通和寫作能力。

2、實驗生物學方向（數(shù)名）

a) 近期（或即將）取得細胞生物學、生物化學與分子生物學等相關(guān)領(lǐng)域的博士學位；

b) 具有扎實的細胞培養(yǎng)、文庫構(gòu)建、生物分子等相關(guān)實驗技能；

c) 以第一作者（含共同）發(fā)表過SCI論文，有一定的獨立工作能力；

d) 對以干濕結(jié)合的方式進行遺傳學機制研究有興趣，有責任心與團隊合作精神；

e) 擁有較為良好的英語溝通和寫作能力；

f) 具有Organoid，iPSC等體外體系建立，及Perturb-seq, CRISPR screening, 單細胞建庫等高通量實驗相關(guān)經(jīng)驗者優(yōu)先。

（二）科研助理/技術(shù)員

1、生物信息學、統(tǒng)計遺傳學方向（1-2名）

a) 近期（或即將）取得生物信息、計算機、數(shù)學、統(tǒng)計、物理、數(shù)據(jù)科學等相關(guān)領(lǐng)域的本科或碩士學歷（無優(yōu)先順序）；

b) 具有一定的編程能力，具有數(shù)理統(tǒng)計或測序數(shù)據(jù)分析基礎(chǔ)；

c) 對生物信息學或基因組學有研究興趣，有責任心與團隊合作精神；

d) 發(fā)表過SCI論文的優(yōu)先。

2、實驗生物學方向（1-2名）

a) 近期（或即將）取得生命科學、醫(yī)學等相關(guān)領(lǐng)域的本科或碩士學歷；

b) 具有細胞培養(yǎng)、文庫構(gòu)建、生物分子等相關(guān)實驗技能；

c) 對以干濕結(jié)合的方式進行遺傳學機制研究有興趣，有責任心與團隊合作精神；

d) 發(fā)表過SCI論文的優(yōu)先。

（三）博士研究生

1、 具有推免資格或符合浙江大學醫(yī)學院“申請審核”制博士研究生招考要求;

2、 對科學研究充滿熱情，對未知領(lǐng)域勇于探索，善于發(fā)現(xiàn)問題和解決問題；

3、 接受過系統(tǒng)的科研訓練，具有嚴謹?shù)目茖W態(tài)度；

4、 具有出色的英文讀寫和溝通能力；

5、 善于溝通交流，有良好的責任心和團隊協(xié)作精神。

二、薪酬待遇

（一）博士后

1、按照本單位博士后管理規(guī)定，提供專業(yè)的科研指導和具有競爭力的待遇年薪23萬+，優(yōu)秀者一人一議；

2、 支持申報博士后科學基金以及其他國家與地方科研項目；

3、課題組與麻省理工、哈佛醫(yī)學院等研究機構(gòu)有合作聯(lián)系，表現(xiàn)優(yōu)異者有機會申請國際交流或推薦聯(lián)合培養(yǎng)；

4、提供一流的科學研究條件和指導，及參加國內(nèi)外高水平學術(shù)會議的機會 ；          

5、 課題組提供積極的工作環(huán)境與靈活的工作制度，為成員的職業(yè)規(guī)劃和發(fā)展提供最大可能的指導和幫助，博士后出站優(yōu)秀者有機會申報良渚實驗室特聘研究員或副研究員，入職杭州工作者可獲得政府資助的安家費及各種人才補貼。

（二）科研助理

課題組提供積極的工作環(huán)境與靈活的工作制度，為成員的職業(yè)規(guī)劃和發(fā)展提供最大可能的指導和幫助，薪資待遇視具體情況，一事一議。

三、招聘程序

請有意者請將以下材料電子版發(fā)送到電子郵箱：xiongxs@mit.edu和xiongxushen1992@gmail.com。詳細的個人簡歷（包括學習工作經(jīng)歷、主要研究工作內(nèi)容、代表性論文論著清單、獲獎情況）及申請人認為其他有借鑒意義的材料。郵件標題請注明“姓名_申請博士后/科研助理/研究生 ”。對于符合要求并通過初審者，將會通知安排面試。應(yīng)聘材料將予以保密。 

為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至：boshijob@126.com（郵件標題格式：應(yīng)聘職位名稱+姓名+學歷+專業(yè)+中國博士人才網(wǎng)）