開展人工智能超級計算精準藥物發(fā)現(xiàn)研究,把最新的人工智能工具用于預測藥物-靶標相互作用,疫苗靶向設計以及藥物篩選(NatureMI),重定位和全新設計實踐之中。開發(fā)了AI藥物發(fā)現(xiàn)軟件SAMM,把深度學習等非線性方法開發(fā)了統(tǒng)計預測模型以及基于web的軟件工具并應用到藥物構效關系,藥物代謝以及毒理和基因表型相關性的研究中,開發(fā)ADMET在線預測平臺,并將其應用到各種典型體系。通過超大規(guī)模的高性能計算和虛擬篩選,我們發(fā)現(xiàn)花椒有效成分WGX-50具有極強的抗炎癥和抗氧化作用,再抗衰老產品開發(fā)中得到了很好的應用。開展新冠的生物信息學研究,發(fā)現(xiàn)了幾個中藥有效成分具有抗新型冠狀病毒作用,篩選出了一個新冠病毒的有效多肽抑制劑——人腸防御素5。通過掩蔽受體,人血管緊張素轉化酶2(ACE2)抑制新冠病毒突刺蛋白對人黏膜細胞的侵襲,從而阻斷新冠病毒傳染途徑,論文發(fā)表在Gastroenterology之上,它解釋了為何病毒不通過消化系統(tǒng)傳染。被“FacultyOpinions”選作推薦論文,并由德國基爾大學的免疫學專家Jens-MichaelSchröder教授進行點評,評論指出了該項工作給預防或治療新冠肺炎提供全新途徑—既可以使用HD5作為治療藥物,也可以通過刺激內源性HD5的合成來預防或治療。為此,魏冬青被評為上海市微生物學會抗疫突出貢獻優(yōu)秀會員。
魏冬青,上海交通大學生命科學技術學院長聘教授,長期從事生物信息學、人工智能輔助藥物設計的研究工作,再交叉學科諸多領域做出了開拓性的工作,特別是首次從理論上證明了特別液晶的存在,首次揭示爆炸微觀反應機理以及發(fā)現(xiàn)并驗證了花椒素的抗衰老作用。在Gastroenterology、JACS、Physical Review Letters、Briefings in Bioinformatics”(交叉科學–計算生命科學)主編,中國衛(wèi)生信息學會大數(shù)據(jù)應用評估與保障專業(yè)委員會副主委, 三、應聘條件
1、近三年內在國內外獲得博士學位,年齡35周歲以下;生物信息學,計算生物學、計算機,數(shù)據(jù)科學等相關專業(yè);
2、具有Python,Perl或者R等編程基礎,具備一定的數(shù)據(jù)建模及機器學習(深度學習)建模技能,有人工智能項目開發(fā)經(jīng)驗者優(yōu)先。
3、有志從事人工智能藥物開發(fā)研究;具備創(chuàng)新精神、獨立工作能力和團隊協(xié)作精神;具有良好的英文寫作與溝通能力;以第一作者的身份發(fā)表SCI研究論文至少1四、崗位職責
1、人工智能抗COVID-19五、崗位待遇
1、年薪不低于24年。上海交通大學為優(yōu)秀博士后提供專有晉升通道。條件優(yōu)秀者出站后可直接申請上海交通大學長聘教軌與研究系列教師。
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